
圖片來源:小編自己的
接上篇,目前很多同學(xué)僅使用其基礎(chǔ)統(tǒng)計功能(如 t 檢驗、ANOVA),而忽略了其高級統(tǒng)計模型(如非線性回歸、生存分析、多變量分析等)。本篇將詳細介紹如何在 GraphPad Prism 中應(yīng)用不同的高級統(tǒng)計模型,包括:
非線性回歸(Nonlinear Regression)
生存分析(Survival Analysis)
多變量分析(Multivariate Analysis)
混合效應(yīng)模型(Mixed Effects Models)
主成分分析(PCA)
快來學(xué)!

1
非線性回歸(Nonlinear Regression)
適用場景:擬合劑量-反應(yīng)曲線、酶動力學(xué)(Michaelis-Menten)、生長曲線(Gompertz)、受體結(jié)合(Sigmoidal dose-response)等。
Step 1:輸入數(shù)據(jù):
在數(shù)據(jù)表中輸入 X(如藥物濃度)和 Y(如反應(yīng)值)。
Step 2:選擇模型:
點擊Analyze → Nonlinear regression (curve fit)

從預(yù)設(shè)模型中選擇(如「Dose-response - Inhibition」或「Kinetics - Michaelis-Menten」)或自定義方程(User-defined equation)

Step 3:調(diào)整參數(shù):

根據(jù)研究目的增加 IC50 或 EC50 的設(shè)置

2
生存分析(Survival Analysis)
適用場景:比較兩組或多組的生存曲線(如臨床試驗中的生存率、動物實驗中的存活時間)。
Step 1:輸入數(shù)據(jù):
列 1:時間(如天數(shù))
列 2:事件(1 = 死亡/事件發(fā)生,0 = 刪失)
分組列(如對照組 vs 處理組)
Step 2:選擇分析:
Analyze → Survival analyses → Survival curve

Step 3:設(shè)置參數(shù):
選擇比較方法(Log-rank test、Gehan-Breslow-Wilcoxon test)

Step 4:
根據(jù)分析結(jié)果標注相關(guān)參數(shù):
Hazard Ratio(HR)(風(fēng)險比)
P 值(組間差異顯著性)

3
多變量分析(Multivariate Analysis)
適用場景:分析多個變量對結(jié)果的影響(如多元線性回歸、邏輯回歸)。
Step 1:輸入數(shù)據(jù):
因變量(X)
多個自變量(Y1, Y2, ...)

Step 2:選擇分析:
Analyze → Multiple regression(線性回歸)
或Analyze → Logistic regression(邏輯回歸)

Step 3:
根據(jù)研究需要設(shè)置參數(shù),選擇相應(yīng)的圖表:

4
混合效應(yīng)模型(Mixed Effects Models)
適用場景:重復(fù)測量數(shù)據(jù)、嵌套數(shù)據(jù)(如不同時間點的測量、同一患者的多次觀測)。
Step 1: 輸入數(shù)據(jù):
點擊Graphs → New Graph →選擇「Grouped」或「XY」圖
X軸:時間(Time)或分組變量(Treatment)。
Y 軸:因變量(Response)。

Step 2:選擇分析:
1
打開數(shù)據(jù)表,點擊Analyze → Mixed Models → Mixed Effects Model。
2
選擇因變量(Response)和固定效應(yīng)(Fixed Effects,如 Treatment、Time)。
3
指定隨機效應(yīng)(Random Effects,如Subject ID)。

Step 3:設(shè)置參數(shù):
定義固定效應(yīng)和隨機效應(yīng)
選擇協(xié)方差結(jié)構(gòu)(如 AR1、Compound Symmetry)
5
主成分分析(PCA)
適用場景:降維、識別數(shù)據(jù)模式(如基因表達、代謝組學(xué)數(shù)據(jù))。
Step 1:輸入數(shù)據(jù):


Step 2:選擇分析:
Analyze → Principal Component Analysis (PCA)

Step 3:設(shè)置參數(shù):
Options 中設(shè)置數(shù)據(jù)的標準化方法和主成分選擇方法。這里標準化方法默認為 Z-score 標準化


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