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圖片來源:小編自己的

接上篇,目前很多同學(xué)僅使用其基礎(chǔ)統(tǒng)計(jì)功能(如 t 檢驗(yàn)、ANOVA),而忽略了其高級(jí)統(tǒng)計(jì)模型(如非線性回歸、生存分析、多變量分析等)。本篇將詳細(xì)介紹如何在 GraphPad Prism 中應(yīng)用不同的高級(jí)統(tǒng)計(jì)模型,包括:

非線性回歸(Nonlinear Regression)

生存分析(Survival Analysis)

多變量分析(Multivariate Analysis)

混合效應(yīng)模型(Mixed Effects Models)

主成分分析(PCA)

快來學(xué)!

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1

非線性回歸(Nonlinear Regression)

適用場(chǎng)景:擬合劑量-反應(yīng)曲線、酶動(dòng)力學(xué)(Michaelis-Menten)、生長(zhǎng)曲線(Gompertz)、受體結(jié)合(Sigmoidal dose-response)等。

Step 1:輸入數(shù)據(jù):

在數(shù)據(jù)表中輸入 X(如藥物濃度)和 Y(如反應(yīng)值)。

Step 2:選擇模型:

點(diǎn)擊Analyze → Nonlinear regression (curve fit)

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從預(yù)設(shè)模型中選擇(如「Dose-response - Inhibition」「Kinetics - Michaelis-Menten」)或自定義方程(User-defined equation

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Step 3:調(diào)整參數(shù):

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根據(jù)研究目的增加 IC50 或 EC50 的設(shè)置

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2

生存分析(Survival Analysis)

適用場(chǎng)景:比較兩組或多組的生存曲線(如臨床試驗(yàn)中的生存率、動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中的存活時(shí)間)。

Step 1:輸入數(shù)據(jù):

列 1:時(shí)間(如天數(shù))

列 2:事件(1 = 死亡/事件發(fā)生,0 = 刪失)

分組列(如對(duì)照組 vs 處理組)

Step 2:選擇分析:

Analyze → Survival analyses → Survival curve

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Step 3:設(shè)置參數(shù):

選擇比較方法(Log-rank test、Gehan-Breslow-Wilcoxon test)

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Step 4:

根據(jù)分析結(jié)果標(biāo)注相關(guān)參數(shù):

Hazard Ratio(HR)(風(fēng)險(xiǎn)比)

P 值(組間差異顯著性)

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3

多變量分析(Multivariate Analysis)

適用場(chǎng)景:分析多個(gè)變量對(duì)結(jié)果的影響(如多元線性回歸、邏輯回歸)。

Step 1:輸入數(shù)據(jù):

因變量(X)

多個(gè)自變量(Y1, Y2, ...)

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Step 2:選擇分析:

Analyze → Multiple regression(線性回歸)

Analyze → Logistic regression(邏輯回歸)

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Step 3:

根據(jù)研究需要設(shè)置參數(shù),選擇相應(yīng)的圖表:

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4

混合效應(yīng)模型(Mixed Effects Models)

適用場(chǎng)景:重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)、嵌套數(shù)據(jù)(如不同時(shí)間點(diǎn)的測(cè)量、同一患者的多次觀測(cè))。

Step 1: 輸入數(shù)據(jù):

點(diǎn)擊Graphs → New Graph →選擇「Grouped」「XY」

X軸:時(shí)間(Time)或分組變量(Treatment)。

Y 軸:因變量(Response)。

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Step 2:選擇分析:

1

打開數(shù)據(jù)表,點(diǎn)擊Analyze → Mixed Models → Mixed Effects Model

2

選擇因變量(Response)和固定效應(yīng)(Fixed Effects,如 Treatment、Time)。

3

指定隨機(jī)效應(yīng)(Random Effects,如Subject ID)。

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Step 3:設(shè)置參數(shù):

定義固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)

選擇協(xié)方差結(jié)構(gòu)(如 AR1、Compound Symmetry)

5

主成分分析(PCA)

適用場(chǎng)景:降維、識(shí)別數(shù)據(jù)模式(如基因表達(dá)、代謝組學(xué)數(shù)據(jù))。

Step 1:輸入數(shù)據(jù):

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Step 2:選擇分析:

Analyze → Principal Component Analysis (PCA)

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Step 3:設(shè)置參數(shù):

Options 中設(shè)置數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化方法和主成分選擇方法。這里標(biāo)準(zhǔn)化方法默認(rèn)為 Z-score 標(biāo)準(zhǔn)化

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下期預(yù)告:

將從宏錄制、腳本編寫到批量處理,手把手教你成為 GraphPad 高效能用戶。

關(guān)于 GraphPad 的使用操作,還有哪些想要了解的,可以留言,我來寫~你來學(xué)~

題圖來源:自制

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