Alphafold橫空出世，差點摧毀結(jié)構(gòu)生物學(xué)

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在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域，有個非常著名的比賽叫做“結(jié)構(gòu)預(yù)測關(guān)鍵評估競賽”（Critical Assessment of Structure Prediction，英文縮寫是CASP）。其實早在2018年的時候，AlphaFold第1代軟件就已經(jīng)參加了比賽，當(dāng)時他們拿到了第一名。但是因為和第二名戴維·貝克研究組的軟件RoseTTA Fold差距并不是太大，所以并沒有引來太多的關(guān)注。但是到了2020年第14屆關(guān)鍵評估比賽上，AlphaFold第2代軟件以不可阻擋的姿態(tài)橫掃所有其他對手，單個蛋白質(zhì)的預(yù)測結(jié)果和實際實驗結(jié)果之間的吻合度高達(dá)92.4%。更關(guān)鍵的是，這個軟件在極短的時間內(nèi)，先后完成了100萬個和2億個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測解析，讓人們第一次意識到計算真的有可能取代結(jié)構(gòu)實驗。

更加橫掃的是在2024年，DeepMind小組發(fā)布了AlphaFold第3代軟件。這一次他們的結(jié)構(gòu)預(yù)測范圍進(jìn)一步涵蓋了蛋白質(zhì)、核酸、還有小分子，更解決了以前所有預(yù)測軟件都無能為力的生物分子之間的相互識別問題。一時之間不只是科學(xué)界，整個產(chǎn)業(yè)界都開始為之瘋狂。