國自然的前期「工作基礎(chǔ)」部分,也是國自然項目判斷延續(xù)性最重要的部分。

需要注意的是,該部分有兩個關(guān)鍵點(diǎn):
與本項目相關(guān)的研究工作積累
已取得的研究工作成績
那么我們就今年審閱的幾百份標(biāo)書,總結(jié)出來的「工作基礎(chǔ)」問題給大家陳述一下:
(一)預(yù)實驗體量不足
這個問題最為突出,可想而知,本身作為臨床醫(yī)生,科研只是附帶做做,哪有精力跟大家一起「卷」,所以最后形成的本子中的預(yù)實驗,往往只有大量的「生信圖」和少量的柱狀圖、WB 結(jié)果。
而除了精力問題導(dǎo)致預(yù)實驗不足以外,還有一個認(rèn)知問題也很嚴(yán)重,就是申請人設(shè)計的國自然假說太簡單導(dǎo)致,殊不知別人的本子不僅思路「卷」、預(yù)實驗也「卷」,所以這就導(dǎo)致「瞎子摸象」的困局,始終摸不到國自然的「真象」,那么距離國自然中標(biāo)也就十分遙遠(yuǎn)。
為什么預(yù)實驗要足夠多?①專家挑刺時,不會以證據(jù)鏈不足秒殺你;②預(yù)實驗多可以彌補(bǔ)一下「文章不夠好」的短板;③預(yù)實驗多,證明你花了很多經(jīng)費(fèi),那你并不是白嫖的態(tài)度來對待國自然,專家也能看到你的努力。
有些同學(xué)會問:會不會因為預(yù)實驗多,專家覺得你都做完了而不予資助?
既然國自然本子包含多方面顧慮,存在各種心理維度的博弈,在面對這個問題時,更愿意相信專家喜歡「預(yù)實驗充足」的本子。
兩害相權(quán)取其輕,永遠(yuǎn)是國自然本子的正解。
所以預(yù)實驗應(yīng)該包括 3-4 張組圖:
① 第一張:證明你的細(xì)胞系和動物模型,成功;
② 第二張:生信分析、分子信號軸關(guān)鍵分子和臨床問題的相關(guān)性,驗證關(guān)鍵分子在臨床樣本、細(xì)胞系和動物模型中的表達(dá)趨勢;
③ 第三張:過表達(dá)或者沉默干預(yù)后,觀察細(xì)胞和動物模型的表型,檢測一下 XXX 通路的激活情況;
④ 第四張:數(shù)據(jù)庫預(yù)測以及分子對接分析;加一個分子互作的實驗圖,證明分子機(jī)制的假說成立。
(二)圖注(legend)不詳實、預(yù)實驗圖模糊不清
字面意思,就是圖注缺失,或者描述過于粗糙,沒有介紹單圖的實驗方法和分組情況。
而有些童鞋的預(yù)實驗圖非常模糊,圖像像素極低,這又不利于專家審閱,不美觀
(三)對照組缺失
對照組包括空白對照、陰性對照、陽性對照,但一般來講,至少要有陰性對照,空白對照可以忽略。陽性對照大部分情況不是必須的,但是藥物實驗中陽性對照卻是必須的。
而過表達(dá)和敲低這種實驗,陰性對照組一定需要,切不可省略。一般用「空白質(zhì)?!埂竤crambles」「sh-NC」「si-NC」「Mock」作為陰性對照組。
(四)內(nèi)參前后文不一致
全細(xì)胞 WB 內(nèi)參一般有 GAPDH、β-actin、β-tubulin 等,但有時候因為代表作屬于早幾年發(fā)表的,所以和現(xiàn)在預(yù)實驗之間的內(nèi)參可能會存在差異,這種都可以理解,但最好是內(nèi)參保持一致。但有時候同一批預(yù)實驗中內(nèi)參也有不一致的情況,還望前后保持一致。
(五)沒有統(tǒng)計顯著性標(biāo)注
預(yù)實驗按理來講都是要做到技術(shù)性重復(fù)和生物學(xué)重復(fù),因此每個實驗務(wù)必形成一個統(tǒng)計學(xué)分析結(jié)果,并且附帶顯著性標(biāo)注「***」「ns(不具有統(tǒng)計學(xué)意義)」等。
當(dāng)然如果預(yù)實驗太多,可以選擇性進(jìn)行統(tǒng)計分析。
(六)WB 條帶背景不均一或者分子量(kDa)沒標(biāo)注
有些 WB 看起來比較假,因為背景不均衡,不均一,像是不同實驗條件下產(chǎn)生的,而且有時候單圖的邊緣有明顯的的切割的痕跡。
另外一個經(jīng)常出現(xiàn)的問題就是:WB 結(jié)果不標(biāo)注分子量。這不是一個特別規(guī)范的學(xué)術(shù)行為。

(七)分子機(jī)制的結(jié)果缺失
分子機(jī)制的證據(jù)鏈往往成本很高,畢竟 CO-IP、pulldown、ChIP、熒光素酶報告實驗等的成本不低,而且往往做了也不一定有陽性結(jié)果,所以很多本子并沒有放分子機(jī)制的預(yù)實驗結(jié)果圖,這也是很多國自然本子的通病之一。解決方案就是用數(shù)據(jù)庫預(yù)測、motif 預(yù)測、各種炫酷的分子對接分析來彌補(bǔ)了。

(八)腫瘤本子預(yù)實驗只有一株細(xì)胞系
強(qiáng)烈建議腫瘤類的本子,預(yù)實驗中最好使用兩株細(xì)胞系做功能實驗,并且腫瘤類的本子一定含有體內(nèi)實驗。
(九)已取得工作成績部分
已取得工作成績部分要簡明扼要,一般的格式是一段話介紹一下自己的科研經(jīng)歷,可以提一下自己的大牛導(dǎo)師;然后列出自己的代表作文章,并標(biāo)注一下作者位次以及中科院分區(qū);挑 2-3 篇文章,把重要的實驗結(jié)論(或者文章的機(jī)制圖)放一張出來,簡單描述一下。而有些同學(xué),把各種實驗圖都抖出來,羅列出 10-20 張小圖,光圖片的序號都排到了十幾,這樣的閱讀感受非常不好,專家讀著累,打分不會太高。
2024 年度國自然醫(yī)學(xué)部 50 大科研熱點(diǎn)中標(biāo)數(shù)統(tǒng)計如下:

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