來(lái)源：西湖大學(xué)
博「后」檔案：帥夢(mèng)雷
本科在華中師范大學(xué)獲得推免資格后，成為西湖大學(xué) 2018 級(jí)博士研究生。經(jīng)過(guò)生命科學(xué)學(xué)院的實(shí)驗(yàn)室輪轉(zhuǎn)后，正式加入鄭鉅圣實(shí)驗(yàn)室，也叫精準(zhǔn)營(yíng)養(yǎng)與計(jì)算醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室。
2023 年順利畢業(yè)，前往博德研究所（Broad Institute of MIT and Harvard）開(kāi)展博后研究。
博「后」報(bào)告
帥夢(mèng)雷的大年初二，早上 8 點(diǎn)就出門(mén)了。
波士頓的緯度接近中國(guó)東北，漫長(zhǎng)的冬季從十月底持續(xù)到來(lái)年四五月。坐公交車要 20 幾分鐘，他掏出手機(jī)檢查日程，今天該和導(dǎo)師匯報(bào)課題了。這座美國(guó)東北的海濱城市，同時(shí)坐落著麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)，而兩所名校中間的博德研究所，是他的目的地。
2023 年夏天，帥夢(mèng)雷從西湖大學(xué)畢業(yè)后來(lái)到這里做博后。
天氣好的時(shí)候，他會(huì)選擇騎自行車去，還能比公交車快一些。
帥夢(mèng)雷在 MIT（圖片由本人提供）
博德研究所的英文名是 Broad Institute of MIT and Harvard，顯然是由麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)共同創(chuàng)立的。這里是全球領(lǐng)先的基因組學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu)之一，知乎上有不少人把它列為生信界的 「 天花板 」，尤其在基因組學(xué)方面是 tier 0 級(jí)別的存在。
這和研究所的發(fā)展史有關(guān)。
博德研究所成立的兩大基石，分別是麻省理工學(xué)院的懷特黑德生物醫(yī)學(xué)研究所（Whitehead Institute) 和哈佛大學(xué)的化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所。據(jù)公開(kāi)資料顯示，2000 年 6 月公布的人類基因組計(jì)劃，有三分之一出自 Whitehead。
帥夢(mèng)雷的博后 「 老板 」Ramnik Xavier，是博德研究所 24 位核心成員之一，炎癥性腸病與腸道微生物組研究的領(lǐng)軍人物。
這是一個(gè)龐大的課題組，接近百人，帥夢(mèng)雷沒(méi)辦法把人認(rèn)全，很多人都這樣。剛來(lái)的時(shí)候，他參加了一次組內(nèi)的交流會(huì)，得知他來(lái)自西湖大學(xué)，在場(chǎng)的博后和研究員表現(xiàn)得并不陌生，但十分好奇，圍住他問(wèn)了不少問(wèn)題。
「 原來(lái)，有這么多人早就知道 『 西湖大學(xué) 』……」 帥夢(mèng)雷有點(diǎn)意外。
在此之前，帥夢(mèng)雷所知的西湖與博德之間的 「 關(guān)聯(lián) 」，僅限于西湖有幾位青年博導(dǎo)曾在博德工作過(guò)，現(xiàn)在算起來(lái)是他的 「 前輩 」。以及，Whitehead 的創(chuàng)始主任、1975 年諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)得主 David Baltimore，是西湖大學(xué)校董會(huì)的創(chuàng)始董事和顧問(wèn)委員會(huì)創(chuàng)始成員。
下午 3 點(diǎn)半，到了和導(dǎo)師討論課題的時(shí)間。
在帥夢(mèng)雷的 「 腸道菌群宇宙 」 里，Ramnik Xavier 這個(gè)名字，最早出現(xiàn)在一篇 Cell 文獻(xiàn)中。在那項(xiàng)研究中，Ramnik Xavier 課題組對(duì) 70 對(duì)母嬰的腸道菌群和代謝組進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)了一種新的母嬰垂直傳遞模式，即母親的腸道菌群如何塑造孩子的腸道菌群。
而腸道菌群，也塑造了帥夢(mèng)雷在西湖的 5 年。
「 在進(jìn)行腸道真菌組研究的日夜里，我曾經(jīng)一次次感受到失敗的痛苦、困難的折磨。真菌注釋不出，表型關(guān)聯(lián)發(fā)現(xiàn)不了，我不禁在想，就這數(shù)據(jù)，我能發(fā)現(xiàn)個(gè)啥？幸運(yùn)的是，我堅(jiān)持了下來(lái)并打破僵局?！?/p>
帥夢(mèng)雷作為畢業(yè)生代表發(fā)言
我們將時(shí)間撥回更早。
2018 年 2 月，西湖大學(xué)獲得教育部批準(zhǔn)成立。帥夢(mèng)雷和導(dǎo)師鄭鉅圣，前后腳搬進(jìn)了石龍山街 18 號(hào)，西湖大學(xué)云棲校區(qū)。一個(gè)剛從華中師范大學(xué)拿到了保研資格，一個(gè)剛剛結(jié)束在英國(guó)劍橋大學(xué)的博后研究。
一切都是新的，校園是新的，實(shí)驗(yàn)室也是新的。
招人、買設(shè)備、建數(shù)據(jù)庫(kù)。鄭鉅圣實(shí)驗(yàn)室的主要研究方向之一，是要圍繞人類腸道真菌組開(kāi)發(fā)實(shí)驗(yàn)方法和分析方法，建立人群腸道真菌基因組數(shù)據(jù)庫(kù)，研究腸道真菌的功能以及營(yíng)養(yǎng)-真菌菌群的互作模式和機(jī)制。
盡管經(jīng)歷過(guò)磨礪，但帥夢(mèng)雷的開(kāi)局已經(jīng)占了一些 「 先機(jī) 」。
「 剛開(kāi)始的任務(wù)，是把上游原始數(shù)據(jù)的生信分析流程建起來(lái)，相當(dāng)于從源頭開(kāi)始學(xué)，」 帥夢(mèng)雷說(shuō)，人群腸道細(xì)菌以及真菌的數(shù)據(jù)庫(kù)相當(dāng)于 「 資料室 」「 圖書(shū)館 」，是實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展課題的基礎(chǔ)，學(xué)弟學(xué)妹可以直接從這里提取并分析數(shù)據(jù)?！?我非常清楚上游的分析手段是怎么回事，所以在后面具體做課題時(shí)會(huì)有更全局的視角，也更敢去嘗試開(kāi)發(fā)不一樣的流程和方法?！?/p>
帥夢(mèng)雷在西湖大學(xué)云棲校區(qū)
這樣的科研訓(xùn)練，用帥夢(mèng)雷的話說(shuō)，是他最終走進(jìn)博德研究所的敲門(mén)磚。
在寫(xiě)給 Ramnik Xavier 的申請(qǐng)信中，帥夢(mèng)雷描述了自己在西湖五年接受的科研訓(xùn)練?，F(xiàn)在回頭看，多維與前沿是真正起作用的兩處關(guān)鍵詞。
西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院有一個(gè)特色，博士生入學(xué)后將進(jìn)行輪轉(zhuǎn)，先去不同的實(shí)驗(yàn)室感受一下，再?zèng)Q定自己 「 落戶 」 到哪里。2018 年，學(xué)校剛剛創(chuàng)立不久，但生科院已經(jīng)有了數(shù)十個(gè)實(shí)驗(yàn)室?！?每一個(gè)的研究方向都很前沿，多數(shù)都涉及到不同學(xué)科的交叉，很有挑戰(zhàn)性?！?帥夢(mèng)雷回憶。
比如，他在生科院研究腸道菌群，但博二、博三兩年，他常常往對(duì)面 2 號(hào)樓的工學(xué)院鞠峰實(shí)驗(yàn)室跑，去聽(tīng)他們的組會(huì)，和那里的博士生討論合作課題的進(jìn)展?！?鞠老師是研究環(huán)境中的微生物，我做的是人體腸道中的菌群，這樣的合作讓我打開(kāi)了另一種看問(wèn)題的角度。」
從上游建數(shù)據(jù)庫(kù)開(kāi)始，到實(shí)驗(yàn)流程和方法創(chuàng)新，帥夢(mèng)雷收獲了完整且扎實(shí)的科研訓(xùn)練。
他感謝西湖，也感謝自己。
帥夢(mèng)雷的畢業(yè)典禮
2023 年的那個(gè)夏天，穿上博士服的帥夢(mèng)雷說(shuō)：
「 我記得這樣一句話，在人的一生中，最為輝煌的一天并不是功成名就的那一天，而是從悲嘆和絕望中產(chǎn)生對(duì)人生挑戰(zhàn)的欲望并且勇敢地邁向這種挑戰(zhàn)的那一天。」
波士頓的 CT2 公交車?？吭?Main St 站，帥夢(mèng)雷走向博德研究所，再次開(kāi)啟了這樣的一天。
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