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來源：西湖大學(xué)

博「后」檔案：帥夢雷

本科在華中師范大學(xué)獲得推免資格后，成為西湖大學(xué) 2018 級博士研究生。經(jīng)過生命科學(xué)學(xué)院的實驗室輪轉(zhuǎn)后，正式加入鄭鉅圣實驗室，也叫精準(zhǔn)營養(yǎng)與計算醫(yī)學(xué)實驗室。

2023 年順利畢業(yè)，前往博德研究所（Broad Institute of MIT and Harvard）開展博后研究。

博「后」報告

帥夢雷的大年初二，早上 8 點就出門了。

波士頓的緯度接近中國東北，漫長的冬季從十月底持續(xù)到來年四五月。坐公交車要 20 幾分鐘，他掏出手機檢查日程，今天該和導(dǎo)師匯報課題了。這座美國東北的海濱城市，同時坐落著麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)，而兩所名校中間的博德研究所，是他的目的地。

2023 年夏天，帥夢雷從西湖大學(xué)畢業(yè)后來到這里做博后。

天氣好的時候，他會選擇騎自行車去，還能比公交車快一些。

帥夢雷在 MIT（圖片由本人提供）

博德研究所的英文名是 Broad Institute of MIT and Harvard，顯然是由麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)共同創(chuàng)立的。這里是全球領(lǐng)先的基因組學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究機構(gòu)之一，知乎上有不少人把它列為生信界的「天花板」，尤其在基因組學(xué)方面是 tier 0 級別的存在。

這和研究所的發(fā)展史有關(guān)。

博德研究所成立的兩大基石，分別是麻省理工學(xué)院的懷特黑德生物醫(yī)學(xué)研究所（Whitehead Institute) 和哈佛大學(xué)的化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所。據(jù)公開資料顯示，2000 年 6 月公布的人類基因組計劃，有三分之一出自 Whitehead。

帥夢雷的博后「老板」Ramnik Xavier，是博德研究所 24 位核心成員之一，炎癥性腸病與腸道微生物組研究的領(lǐng)軍人物。

這是一個龐大的課題組，接近百人，帥夢雷沒辦法把人認全，很多人都這樣。剛來的時候，他參加了一次組內(nèi)的交流會，得知他來自西湖大學(xué)，在場的博后和研究員表現(xiàn)得并不陌生，但十分好奇，圍住他問了不少問題。

「原來，有這么多人早就知道『西湖大學(xué) 』……」帥夢雷有點意外。

在此之前，帥夢雷所知的西湖與博德之間的「關(guān)聯(lián) 」，僅限于西湖有幾位青年博導(dǎo)曾在博德工作過，現(xiàn)在算起來是他的「前輩」。以及，Whitehead 的創(chuàng)始主任、1975 年諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎得主 David Baltimore，是西湖大學(xué)校董會的創(chuàng)始董事和顧問委員會創(chuàng)始成員。

下午 3 點半，到了和導(dǎo)師討論課題的時間。

在帥夢雷的「腸道菌群宇宙」里，Ramnik Xavier 這個名字，最早出現(xiàn)在一篇 Cell 文獻中。在那項研究中，Ramnik Xavier 課題組對 70 對母嬰的腸道菌群和代謝組進行分析，發(fā)現(xiàn)了一種新的母嬰垂直傳遞模式，即母親的腸道菌群如何塑造孩子的腸道菌群。

而腸道菌群，也塑造了帥夢雷在西湖的 5 年。

「在進行腸道真菌組研究的日夜里，我曾經(jīng)一次次感受到失敗的痛苦、困難的折磨。真菌注釋不出，表型關(guān)聯(lián)發(fā)現(xiàn)不了，我不禁在想，就這數(shù)據(jù)，我能發(fā)現(xiàn)個啥？幸運的是，我堅持了下來并打破僵局?！?/p>

帥夢雷作為畢業(yè)生代表發(fā)言

我們將時間撥回更早。

2018 年 2 月，西湖大學(xué)獲得教育部批準(zhǔn)成立。帥夢雷和導(dǎo)師鄭鉅圣，前后腳搬進了石龍山街 18 號，西湖大學(xué)云棲校區(qū)。一個剛從華中師范大學(xué)拿到了保研資格，一個剛剛結(jié)束在英國劍橋大學(xué)的博后研究。

一切都是新的，校園是新的，實驗室也是新的。

招人、買設(shè)備、建數(shù)據(jù)庫。鄭鉅圣實驗室的主要研究方向之一，是要圍繞人類腸道真菌組開發(fā)實驗方法和分析方法，建立人群腸道真菌基因組數(shù)據(jù)庫，研究腸道真菌的功能以及營養(yǎng)-真菌菌群的互作模式和機制。

盡管經(jīng)歷過磨礪，但帥夢雷的開局已經(jīng)占了一些「先機」。

「剛開始的任務(wù)，是把上游原始數(shù)據(jù)的生信分析流程建起來，相當(dāng)于從源頭開始學(xué)，」帥夢雷說，人群腸道細菌以及真菌的數(shù)據(jù)庫相當(dāng)于「資料室」「圖書館」，是實驗室開展課題的基礎(chǔ)，學(xué)弟學(xué)妹可以直接從這里提取并分析數(shù)據(jù)?！?我非常清楚上游的分析手段是怎么回事，所以在后面具體做課題時會有更全局的視角，也更敢去嘗試開發(fā)不一樣的流程和方法?！?/p>

帥夢雷在西湖大學(xué)云棲校區(qū)

這樣的科研訓(xùn)練，用帥夢雷的話說，是他最終走進博德研究所的敲門磚。

在寫給 Ramnik Xavier 的申請信中，帥夢雷描述了自己在西湖五年接受的科研訓(xùn)練?，F(xiàn)在回頭看，多維與前沿是真正起作用的兩處關(guān)鍵詞。

西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院有一個特色，博士生入學(xué)后將進行輪轉(zhuǎn)，先去不同的實驗室感受一下，再決定自己「落戶」到哪里。2018 年，學(xué)校剛剛創(chuàng)立不久，但生科院已經(jīng)有了數(shù)十個實驗室?！?每一個的研究方向都很前沿，多數(shù)都涉及到不同學(xué)科的交叉，很有挑戰(zhàn)性?！?帥夢雷回憶。

比如，他在生科院研究腸道菌群，但博二、博三兩年，他常常往對面 2 號樓的工學(xué)院鞠峰實驗室跑，去聽他們的組會，和那里的博士生討論合作課題的進展?！?鞠老師是研究環(huán)境中的微生物，我做的是人體腸道中的菌群，這樣的合作讓我打開了另一種看問題的角度?！?/p>

從上游建數(shù)據(jù)庫開始，到實驗流程和方法創(chuàng)新，帥夢雷收獲了完整且扎實的科研訓(xùn)練。

他感謝西湖，也感謝自己。