

孟德爾實(shí)驗(yàn)
160年前,奧地利修道士孟德爾(Gregor Johann Mendel)在修道院的花園里種下了上萬株豌豆(
Pisum sativum),并系統(tǒng)研究了豌豆的七個(gè)可觀察性狀:種子形狀(圓/皺)、種子顏色(黃/綠)、豆莢形狀(飽滿/收縮)、豆莢顏色(綠/黃)、花色(紫/白)、植株高度(高/矮)以及花的位置(腋生/頂生)。
近幾十年來,科學(xué)家不斷將這些性狀映射到DNA序列上,逐步解析其基因基礎(chǔ)。最早被確認(rèn)的,是控制種子形狀的基因。隨后,研究人員相繼識(shí)別出控制植株高度、花色和種子顏色的相關(guān)基因。然而,在孟德爾所提出的七種性狀中,仍有三項(xiàng)未能明確其基因基礎(chǔ)。
近日,一項(xiàng)由中國科學(xué)家主導(dǎo)的國際研究團(tuán)隊(duì),為孟德爾留下的遺傳故事增添了新的篇章。研究團(tuán)隊(duì)結(jié)合了基因組學(xué)、生物信息學(xué)與遺傳學(xué)手段,構(gòu)建了全球豌豆品種的多樣性圖譜,明確了其余三種性狀背后的基因,并識(shí)別出許多可供育種者利用的有用基因。
解鎖基因組
研究人員從全球約3500份豌豆樣本中,精選出700份具有代表性的樣本進(jìn)行深度測(cè)序,識(shí)別出1.55億個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)的遺傳標(biāo)記,構(gòu)建出覆蓋馴化品種、地方品種和野生親緣種的全球豌豆基因組圖譜。
基于這些數(shù)據(jù),研究團(tuán)隊(duì)確定了與可以控制豆莢顏色、豆莢形狀和花的位置的基因。例如,他們發(fā)現(xiàn),豆莢的顏色是由一種干擾葉綠素生物合成的基因控制的,這種基因會(huì)導(dǎo)致豌豆莢要么是綠色的,要么是黃色的。
除了將基因與剩下的三個(gè)性狀聯(lián)系起來之外,研究團(tuán)隊(duì)還利用全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)技術(shù),分析了72項(xiàng)與農(nóng)業(yè)相關(guān)的豌豆形狀,并將這些形狀與相應(yīng)的基因組位置聯(lián)系了起來。這些位置上的許多不同的遺傳標(biāo)記可以用來加速豌豆的改良。
這項(xiàng)研究產(chǎn)生了62TB的原始數(shù)據(jù),相當(dāng)于25.6萬億條信息,若打印出來可鋪滿36億張A4紙。這些數(shù)據(jù)已全部公開,仍有大量信息等待深入挖掘。
延續(xù)與躍遷
孟德爾在19世紀(jì)進(jìn)行的雜交實(shí)驗(yàn),總共涉及約28,000株豌豆。他在尚不知“基因”為何物的時(shí)代,通過觀察性狀分離,揭示了顯性與隱性遺傳的規(guī)律,奠定了現(xiàn)代遺傳學(xué)的根基。有科學(xué)史學(xué)家稱其為“有史以來最好的實(shí)驗(yàn)”。
那時(shí),孟德爾之所以選擇豌豆作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,不僅因?yàn)樗抢硐氲哪J缴?,也因?yàn)樗且环N重要的經(jīng)濟(jì)作物。他希望通過實(shí)驗(yàn)幫助解決種植中的真實(shí)問題來改進(jìn)這一作物。如今,這項(xiàng)新的研究不僅補(bǔ)充并擴(kuò)展了孟德爾的發(fā)現(xiàn),也為包括中國在內(nèi)的多個(gè)國家的豌豆種植和育種提供了關(guān)鍵支持。
豌豆作為一種豆科作物,不僅蛋白質(zhì)含量高,且具備固氮能力,有助于減少化肥使用,降低農(nóng)業(yè)對(duì)土地與水體的環(huán)境壓力。這些特性使其成為發(fā)展可持續(xù)農(nóng)業(yè)的重要作物。新的研究成果為全球科學(xué)家和育種家提供了一套全新的基因庫與基因組資源,有望徹底變革豌豆的育種方式,并為這類具有重要生態(tài)意義的豆科作物的研究打開新的篇章。
展望未來,這些基因組資源將與基因編輯、RNA測(cè)序、長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序等先進(jìn)技術(shù)結(jié)合使用,進(jìn)一步推動(dòng)新基因的發(fā)現(xiàn),發(fā)展更具預(yù)測(cè)性的育種方法。例如,利用人工智能模型篩選最優(yōu)基因組合,有望培育出高產(chǎn)、抗病、營(yíng)養(yǎng)豐富的豌豆新品種,為全球農(nóng)業(yè)帶來切實(shí)收益。
#參考來源:
https://www.jic.ac.uk/press-release/a-legacy-unlocked-mendel-inspired-breakthrough-that-could-transform-global-pea-farming/
https://www.nature.com/articles/d41586-025-01269-8
https://www.science.org/content/article/massive-pea-study-solves-last-genetic-riddles-famed-friar
#圖片來源:
封面圖&首圖:John Innes Centre
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