【寫在前面】：之前有分享過網(wǎng)藥+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的寫作思路，今天以具體文章為例子~
思路：首先篩選中藥的活性成分和靶點(diǎn)以及疾病靶點(diǎn)——取靶點(diǎn)的交集——PPI 分析——核心靶點(diǎn)篩選——GO和KEGG分析——構(gòu)建“成分-目標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò)——實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
【文章題目】Exploring the Effects and Mechanisms of Valerian Volatile Oil in Treating Insomnia Using Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulation-Based Approaches
使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接和基于分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法探索纈草揮發(fā)油治療失眠的效果和機(jī)制
【摘要】
纈草具有多種藥理作用，包括鎮(zhèn)靜和催眠特性、抗高血壓作用、抗菌活性和肝臟保護(hù)作用。失眠是當(dāng)代社會(huì)最普遍的疾病之一，對(duì)人們的日常生活產(chǎn)生重大影響。本研究旨在通過化學(xué)分析、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)模擬和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，探討纈草揮發(fā)油 （VVO） 的抗失眠作用，并探討其潛在作用機(jī)制。通過氣相色譜-質(zhì)譜 （GC-MS） 分析和藥物相似性篩選，我們鑒定了 38 種活性化合物。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究表明，這 38 種化合物可能影響 103 個(gè)與失眠相關(guān)的靶點(diǎn)，如單胺氧化酶 B （MAOB）、多巴胺受體 D2 （DRD2）、單胺氧化酶 A （MAOA）、白細(xì)胞介素 1β （IL1B）、溶質(zhì)載體家族 6 成員 4 （SLC6A4）、前列腺素-內(nèi)過氧化物合酶 2 （PTGS2） 和 5-羥色胺受體 2A （HTR2A），有助于調(diào)節(jié)神經(jīng)活性配體-受體相互作用， 5-羥色胺能突觸和鈣信號(hào)通路。分子動(dòng)力學(xué)模擬的結(jié)果表明，雙[（6,6-二甲基-3-雙環(huán)[3.1.1]庚-2-烯基）甲基] （E）-丁-2-烯二酸酯表現(xiàn)出與 MAOB 的穩(wěn)定相互作用。動(dòng)物研究表明，灌胃施用高劑量 （100 mg/kg） 的 VVO 可顯著降低小鼠的自主活動(dòng)、減少睡眠潛伏期并延長睡眠時(shí)間。此外，Western blot 實(shí)驗(yàn)的結(jié)果表明，VVO 與 MAOB 相互作用，導(dǎo)致大腦皮層中 MAOB 的表達(dá)水平降低。本研究通過化學(xué)分析、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證證明了 VVO 對(duì)失眠的保護(hù)機(jī)制，并擴(kuò)展了 VVO 的可能應(yīng)用，VVO 是一種用于失眠治療的潛在治療成分。
【結(jié)果部分】
1.GC-MS 分析
2.失眠靶點(diǎn)的的預(yù)測(cè)和交叉靶點(diǎn)的篩選 3.構(gòu)建 PPI 網(wǎng)絡(luò)
4.GO 功能和 KEGG 通路富集分析 5.構(gòu)建“成分-目標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò)
6.分子對(duì)接結(jié)果
7.分子模擬結(jié)果
8. VVO 對(duì)戊巴比妥誘導(dǎo)小鼠睡眠時(shí)間潛伏期和睡眠時(shí)間持續(xù)時(shí)間的影響
9.VVO 對(duì)小鼠自主活動(dòng)的影響
10.VVO 對(duì)大腦皮層 MAOB 蛋白水平的影響
【結(jié)論與討論】寫作思路
綜上所述，我們的研究結(jié)果闡明了 VVO 通過多種成分和多個(gè)靶點(diǎn)治療失眠，其中 MAOB、MAOA、SLC6A4、HTR2A 和其他在血清素能突觸中起著至關(guān)重要的作用 VVO 治療失眠。這些研究結(jié)果為 VVO 治療失眠的臨床應(yīng)用提供了理論支持和研究數(shù)據(jù)，初步揭示了 VVO 治療失眠的藥效學(xué)基礎(chǔ)和藥理作用機(jī)制。然而，我們的研究也有一些局限性。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究通?；谟?jì)算預(yù)測(cè)，但在未來的研究中，有必要整合其他更直接和精確的方法（如高通量測(cè)序）來驗(yàn)證我們的發(fā)現(xiàn) 。
注：本文原創(chuàng)表明為原創(chuàng)編譯，非聲張版權(quán)，侵刪！
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