打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

2025年4月27日,NMPA公布了創(chuàng)新醫(yī)療器械特別審查申請審查結(jié)果公示(2025年第4號),有9款產(chǎn)品進(jìn)入創(chuàng)新通道。其中包括,廣州市金圻睿生物科技有限責(zé)任公司申請的結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群耐藥基因突變檢測試劑盒(可逆末端終止測序法)。

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

# 結(jié)核

結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)引起的嚴(yán)重傳染病,是全球公共衛(wèi)生的重大威脅之一。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)發(fā)布的《2022年全球結(jié)核病報告》:

  • 2021年,全球共有160萬人死于結(jié)核病,包括18.7萬例結(jié)核病/艾滋病毒(TB/HIV)雙重感染患者。結(jié)核病是全球第13大死因,僅次于COVID-19。

  • 2021年,全球新發(fā)耐多藥和利福平耐藥(MDR/RR-TB)結(jié)核病患者達(dá)45萬例,而其治療成功率僅為60%。

全球新發(fā)MDR/RR-TB患者中,僅有16.1萬例接受了治療,仍有28.9萬例未能及時診治,占比近65%

中國是結(jié)核病、艾滋病毒感染相關(guān)結(jié)核病以及耐多藥和利福平耐藥結(jié)核病(MDR/RR-TB)的高負(fù)擔(dān)國家之一。2021年,中國結(jié)核病估算發(fā)病人數(shù)占全球總數(shù)的7.4%,位居第三。耐藥結(jié)核病的治療成功率僅為53%,遠(yuǎn)低于普通結(jié)核病的95%。

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

▲全球結(jié)核病、艾滋病毒感染相關(guān)結(jié)核病和耐藥結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國家名單

耐藥結(jié)核病的嚴(yán)峻形勢

耐藥結(jié)核病的出現(xiàn)進(jìn)一步加劇了結(jié)核病的防控難度。耐多藥結(jié)核病(MDR-TB)廣泛耐藥結(jié)核?。╔DR-TB)對一線抗結(jié)核藥物(如利福平、異煙肼)產(chǎn)生耐藥性,導(dǎo)致治療難度增加、治愈率下降和死亡率上升。耐藥結(jié)核病的傳播不僅增加了公共衛(wèi)生負(fù)擔(dān),還對患者造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)和健康負(fù)擔(dān)。

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

傳統(tǒng)檢測方法的局限性

傳統(tǒng)的耐藥性檢測方法主要依賴于細(xì)菌培養(yǎng)和藥敏試驗,這些方法耗時長(通常需要數(shù)周甚至數(shù)月),無法滿足快速診斷和精準(zhǔn)治療的需求。此外,傳統(tǒng)方法的靈敏度和特異性較低,難以準(zhǔn)確檢測低豐度的耐藥突變??焖俜肿訖z測雖然能夠提供較快的結(jié)果,但僅能識別有限的耐藥性突變,無法全面覆蓋所有耐藥相關(guān)基因。

#可逆末端終止測序法

經(jīng)查詢了解,可逆末端終止測序法(Reversible Terminator Sequencing,簡稱RTS)是一種高精度的DNA測序技術(shù),屬于新一代測序(Next Generation Sequencing, NGS)技術(shù)的一種。其核心原理是通過在DNA合成過程中使用帶有可逆終止基團(tuán)的核苷酸,實現(xiàn)單堿基分辨率的測序。

具體步驟如下:

  • DNA模板固定:將待測序的DNA片段固定在固體表面(如測序芯片)上。

  • 引物結(jié)合:在DNA模板上結(jié)合一個短的引物,作為DNA合成的起始點。

  • 核苷酸添加:在DNA聚合酶的作用下,帶有可逆終止基團(tuán)的核苷酸(dNTP)被逐個添加到引物的3'末端。每次添加的核苷酸帶有不同的熒光標(biāo)記,用于區(qū)分不同的堿基。

  • 熒光檢測:每次添加一個核苷酸后,通過熒光成像系統(tǒng)檢測熒光信號,確定添加的堿基類型。

  • 終止基團(tuán)去除:在檢測完一個堿基后,通過化學(xué)方法去除終止基團(tuán),使DNA鏈能夠繼續(xù)延伸。

  • 重復(fù)循環(huán):重復(fù)上述步驟,逐個添加核苷酸并檢測熒光信號,直到完成整個DNA片段的測序。

該技術(shù)具有高精度、高通量、快速檢測和低背景干擾的特點。它通過逐個添加核苷酸并檢測熒光信號,能夠?qū)崿F(xiàn)單堿基分辨率的測序,從而顯著提高測序的準(zhǔn)確性和靈敏度。同時,該技術(shù)可以在同一測序芯片上同時進(jìn)行多個DNA片段的測序,大大提高了測序效率。

此外,整個測序過程可以在較短時間內(nèi)完成,非常適合快速診斷和臨床應(yīng)用。由于每次只添加一個核苷酸,背景熒光信號較低,這進(jìn)一步提高了信噪比,確保了檢測結(jié)果的可靠性。

# 靶向測序技術(shù)(tNGS)

靶向測序技術(shù)(tNGS)將超多重PCR/雜交捕獲與二代測序的優(yōu)勢整合,通過其高度準(zhǔn)確的特異性和廣泛的基因組覆蓋能力,能夠更加精確地分析特定基因區(qū)域的變異情況,提供更全面、更準(zhǔn)確的耐藥性信息,為耐藥結(jié)核的早期診斷、個性化治療、防控策略分析提供有力工具。其技術(shù)優(yōu)勢可歸納為以下幾點:

  • 檢測成本及耗時較低

  • 不受人類基因組及背景菌影響

  • 強化表型基因檢測性能

  • 對病原體進(jìn)行真實定量檢測

  • 強化RNA病毒、胞內(nèi)菌以及被吞噬病原體檢測能力

# 結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群耐藥基因突變檢測試劑盒(可逆末端終止測序法)

結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群耐藥基因突變檢測試劑盒(可逆末端終止測序法)基于靶向測序技術(shù)(tNGS),將超多重PCR與二代測序技術(shù)相結(jié)合,通過以下步驟實現(xiàn)高精度的耐藥基因檢測:

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

  • 樣本處理:采用物理研磨和生化酶解相結(jié)合的方法,實現(xiàn)高效破壁,確保樣本中結(jié)核分枝桿菌的DNA能夠充分釋放。

  • 多重PCR擴(kuò)增:針對結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTBC)的耐藥基因,設(shè)計多對引物,覆蓋13個耐藥基因的200多個突變位點。通過超多重PCR擴(kuò)增,確保每個靶標(biāo)區(qū)域都能被充分?jǐn)U增。

  • 測序:采用可逆末端終止測序法(SBS),通過邊合成邊測序的方式,實現(xiàn)高精度的單核苷酸多態(tài)性(SNP)檢測。測序過程中設(shè)置內(nèi)參基因和空白對照,避免環(huán)境病原體污染。

  • 數(shù)據(jù)分析:利用自主研發(fā)的核心算法,對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,精準(zhǔn)識別耐藥基因突變,并評估耐藥異質(zhì)性。

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

檢測范圍覆蓋結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTBC)及12種一線/二線抗結(jié)核藥物的耐藥基因(13個耐藥基因,200多個突變位點)。并且采用一管法PCR建庫技術(shù),所有反應(yīng)過程在同一管內(nèi)完成,有效避免建庫過程中的氣溶膠污染。測序運行時間低于5小時,實驗總周期(TAT)小于12小時,能夠快速提供檢測結(jié)果。

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

技術(shù)優(yōu)勢

  • 早期檢測:靈敏度低至50個菌/mL,能夠檢測到低濃度的分枝桿菌DNA,甚至在感染初期就能夠捕獲耐藥變異,從而在早期診斷中發(fā)揮著重要作用;

  • 多基因耐藥性分析:允許多種抗生素耐藥基因平行分析,快速而準(zhǔn)確地預(yù)測耐藥性;

  • 流行病學(xué)和傳播途徑分析:可以用于分析不同菌株之間的遺傳關(guān)系,揭示傳播途徑,有助于制定更有針對性的結(jié)核防控策略;

  • 加速診斷和研究流程:高通量性能使得整個檢測和分析流程更加高效,在較短時間內(nèi)提供豐富的信息,加速結(jié)核耐藥性的研究和臨床應(yīng)用。

# 臨床數(shù)據(jù)

根據(jù)金圻睿生物發(fā)布的研究數(shù)據(jù),其結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群耐藥基因突變檢測試劑盒(可逆末端終止測序法)在臨床樣本中的表現(xiàn)如下:

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

研究共納入143株結(jié)核分枝桿菌(MTB)臨床分離株和158份支氣管肺泡灌洗液(BALF)樣本。

與傳統(tǒng)方法的對比,tNGS與表型抗菌藥物敏感性試驗(AST)的一致性平均為95.10%,與全基因組測序(WGS)的一致性平均為97.05%

在158份BALF樣本中,tNGS陽性率為87.95%(73/83),高于Xpert MTB/RIF的80.72%(67/83)。

另外,tNGS能夠檢測到全部45種耐藥相關(guān)基因的突變,且與表型AST的耐藥率差異不超過5%。

# 同類型產(chǎn)品

  • Cepheid的Xpert MTB/RIF

Cepheid的Xpert MTB/RIF基于實時熒光定量PCR技術(shù),快速檢測結(jié)核分枝桿菌和利福平耐藥,靈敏度為133個菌/mL,特異性高,檢測時間僅需2小時。該產(chǎn)品適合臨床快速篩查,能夠快速提供診斷結(jié)果,幫助醫(yī)生及時調(diào)整治療方案。

  • Hain Lifescience的GenoType MTBDRplus

Hain Lifescience的GenoType MTBDRplus采用線性探針雜交技術(shù),檢測結(jié)核分枝桿菌、利福平和異煙肼耐藥,靈敏度和特異性均為中等,檢測時間為48小時。該產(chǎn)品適合常規(guī)耐藥檢測,能夠為臨床提供基礎(chǔ)的耐藥信息。

  • Becton Dickinson的BD MAX MDR-TB

Becton Dickinson的BD MAX MDR-TB基于實時熒光定量PCR技術(shù),能夠檢測結(jié)核分枝桿菌、利福平、異煙肼和喹諾酮類耐藥基因,靈敏度和特異性較高,檢測時間僅需2小時。該產(chǎn)品適合快速耐藥檢測,能夠為臨床提供多種耐藥基因的檢測結(jié)果,幫助醫(yī)生制定更精準(zhǔn)的治療方案。

# 關(guān)于金圻睿

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

廣州市金圻睿生物科技有限責(zé)任公司(簡稱“金圻?!保┯?016年成立,聚焦于精準(zhǔn)醫(yī)療體外診斷產(chǎn)品的研發(fā)、生產(chǎn)、銷售,致力于滿足臨床各類型的應(yīng)用需求,提供適用各類醫(yī)療機構(gòu)真正本地化的精準(zhǔn)分子診斷整體解決方案。

金圻?;谧灾鲃?chuàng)新研發(fā)了多重PCR、超多重靶向測序(tNGS)、宏基因組(mNGS)、腫瘤NGS等技術(shù)和系列自動化儀器設(shè)備,取得了多項核心技術(shù)發(fā)明專利,實現(xiàn)了腫瘤+感染多層次雙產(chǎn)品線布局。

打開網(wǎng)易新聞 查看精彩圖片

其中,多重PCR熔解曲線專利技術(shù),實現(xiàn)了單管一次性可檢測二十五重靶標(biāo);超多重靶向病原測序技術(shù),實現(xiàn)了單管檢測超千重靶標(biāo);MetaCAP宏捕獲技術(shù),重點捕獲3000多種臨床感染相關(guān)病原體,可檢測兩萬多種微生物及其耐藥和毒力基因。上述特色技術(shù)已開發(fā)了呼吸道、生殖道、消化道等多種多重病原體檢測試劑。

2020年,金圻睿的KMMiniSeqDx-CN基因測序儀獲得NMPA三類注冊證;2022年,腫瘤多基因檢測試劑盒獲得NMPA三類注冊證。金圻睿是國內(nèi)為數(shù)不多可提供基因測序儀+臨床應(yīng)用+軟件的腫瘤伴隨診斷系統(tǒng)解決方案的公司之一。